É esse o critério do IPMA para ondas de Sueste no Algarve...
http://www.ipma.pt/pt/enciclopedia/otempo/sam/index.html?page=criterios.xml
Sim tens razão, penso que deva ter qualquer coisa a haver com as fortes correntes que geralmente uma corrente de sueste costuma trazer, lembro-me de por vezes no Verão ter ondas de 2 metros, e aquilo ficar com umas correntes muitos fortes e perigosas.
Penso que o critério diferencial tenha qualquer coisa a haver com isso, e reparei que o critério de aviso vermelho é para ondas de altura superior a 4/5 metros, apenas quando elas forem de sueste.
É curioso de facto, mas continuo a achar a previsão de ondas bastante curtas